Master of Orion 2 kenn ich nicht, aber ich würde dir nach deiner Beschreibung folgende Spiele empfehlen:
Star Trek - Birth of the Federation (Rundenbasiert, Diplomatie, Forschung, Geheimdienst, Kolonisation, viele Fraktionen möglich, Kriege, etc)
Star Trek - Armada (Echtzeit, Fokus liegt auf dem schnellen aufbauen einer großen Flotte, bzw einer Armada^^)
Star Trek - Armada 2 (siehe oben)