An sich darf (und kann) der Kühler im Normalfall nicht wirklich vibrieren.
Zumindest nicht mehr, als der Rest des Systems.
Nun kann es sein, irgendwie baut sich in Deinem System Infraschall auf.
Du hast da also womöglich Schwingungen, die derartig niederfrequent sind, dass man sie schon gar nicht mehr hören, gleichwohl aber spüren kann.
Langsamlaufende Lüfter mit erheblicher Unwucht, egal ob im Gehäuse, im NT oder auf dem Kühler selbst könnten hier so ziemlich die einzige zu beseitigende Ursache sein.
Einfach mal kurz alle Lüfter anhalten, um zu schauen ob sich was ändert.
Wenn "kurz" kurz bleibt, ist das gänzlich ungefährlich für die verbaute Hardware, wie auch für die Lüfter selbst.
(An der Nabe bremsen!)
Für's Netzteil ist diese Bremse natürlich unbrauchbar.
Aber mit dem Finger auf dem Netzteil-Gehäuse testen, ob das Teil eventuell auch vor sich hin vibriert, sollte ohne Weiteres machbar sein.